Mal ganz out of the box gedacht: Du könntest auch gänzlich auf Bodengrund verzichten. Sein Aquarium "bare bottom" zu fahren hat unter anderem den Vorteil, dass du eben keinen Bodengrund hast, der sowohl negativ als auch positiv in deine Wasserchemie eingreifen kann.
Du könntest also stückweise den Sand absaugen. Jede Woche vielleicht paar Hände voll, bis du ihn los bist. Ist für die Biologie wahrscheinlich der schonungsvollste Weg.